С окончанием активной фазы боевых действий вновь обострились затихшие было противоречия между «Крунком» и «Маштоцем». Пользуясь своей близостью к власти, «Крунку» удалось протащить вопрос об объединении общин в одну под руководством Альберта Тополяна, который занял высокий пост в правительстве Республики Абхазия и возглавил объединенную общину.
Гагрская община «Маштоц» продолжала свое функционирование уже как составная часть сухумской, однако, вновь заметно дистанцировалась от политики, предпочитая решать социальные проблемы диаспоры. С исчезновением угрозы национализма в Абхазии, исчезла необходимость и в полувоенной структуре общины. Армянские общины Абхазии расформировали оба армянских батальона и вплотную занялись проблемами армянского населения Восточной Абхазии, которые после войны оказались на новом фронте. Этот невидимый фронт минно-террористической войны прошел через армянские села Гулрыпшского района в Кодорском ущелье. Однако, не смотря на предпринятые меры безопасности, в октябре 2001 года произошла трагедия. Боевики из банды чеченского полевого командира Руслана Гелаева и представителя президента Грузии в Кодорском ущелье Эмзара Квициани, ворвались в армянские села Наа и Георгиевское. В результате резни, учиненной (по свидетельству пленных – Л.А.) грузинскими боевиками отряда, было убито 14 мирных жителей. Первыми на пути банды, рвавшейся к Сухуму, встали бойцы министерства обороны Абхазии и жители армянского села Цебельда, находившегося чуть ниже по течению реки Кодор. В результате чего им удалось отбить наступление значительно превосходивших сил противника и дать время министерству обороны подтянуть в район технику и резервистов.